第二条时间线后的一切，就是原著所发生的那样，可显然，游擎从红龙的预示中看到了结果。

即便不动游星等人决定以团结牵绊之力给世界带去更加光明的未来和希望，可结局仍不圆满，最终发生了什么事情不得而知，但《游戏王》的故事就在5Ds后戛然而止，后续的事件都变成了在各个平行宇宙发生……

在精灵界和冰结界的还零龙·三叉龙战斗的时候，游擎看到了上一条，也就是第三条时间线。

在聆听到卡牌精灵的声音，逐渐解锁了疾行机人卡组的过程中，红龙给与游擎有关时间线的记忆不断清晰。

他渐渐梳理出，在原著结局之后，出于某些难以直接解释的神秘因素，时空次元裂解，变成了无数个平行宇宙。

ZEXAL、ARC-V、VRAINS甚至是SEVENS都只是其中的几个平行次元……

某个有着强烈怨念的恐怖存在不甘心这样的结果，于是引发了第二次回档，开辟出了第三条时间线。

从拼凑零碎时空碎片的过程中，游擎看到，那第三条时间线里同样出现了自己的身影。

由于在比赛中的意外，红龙以卡牌的力量为媒介，将自己传送到了第三条时间线的次元。

开辟出这第三条时间线的终极Boss名为——Parallel，帕瑞拉尔。

裂解的世界让帕瑞拉尔无尽痛苦，渴望结束那痛苦的他，决定将世界归零，也就是从源头将整个决斗世界抹除！！

于是，帕瑞拉尔像当初的未来组一样，用自己的方式修改着时间线，并与第三条时间线的未来组组成了“新未来组”进行新的行动。

而为了对抗他们极端的毁灭行为，红龙将选中的穿越者——游擎招来，并不断引导。

最终，在第三条时间线的末尾，游擎和不动游星等人与新未来组展开决战。

以Zone为首的未来组本就难以战胜，而终极Boss——帕瑞拉尔更是有着多重次元的力量，掌握着超量、灵摆、链接等所有次元的方式！！

但最后的最后，由于游擎作为穿越者，同样知晓了解所有其他次元的召唤方式，所以帕瑞拉尔还是没能战胜承载着无数羁绊之力的游擎，彻底堕入到了多重次元的缝隙之间。

第三条时间线的结局是，在红龙的力量下，游擎回到了原来的世界，而不动游星等人更加明晰了未来将会面对的真正灾难，所以他们开始了更具有方向和针对性的努力。